Escape патогены что это
Обновлено: 02.07.2024
Аннотация научной статьи по клинической медицине, автор научной работы — Кузьменков Алексей Юрьевич
Цель. Проанализировать этиологическую структуру возбудителей нозокомиальных хирургических инфекций в многопрофильных стационарах Российской Федерации. Методика. Представленная работа является ретроспективной и основана на данных, полученных в рамках проспективных многоцентровых эпидемиологических исследований антибиотико-резистентности за период с 1997 по 2015 гг. Всего в исследование было включено 5118 пациентов с установленным фактом наличия нозокомиальной хирургической инфекции из 37 городов Российской Федерации. Результаты. Полученные данные отражают возрастно-половой состав изучаемой группы пациентов, этиологическую структуру и её изменение с течением времени в различных федеральных округах Российской Федерации. Так среди обследованных пациентов мужчины составили 61,77%, женщины 38,23%. Возрастные характеристики в зависимости от пола распределились следующим образом: медиана возраста мужчин составила 48 (34; 59) лет, медиана возраста женщин 53 (39; 67) лет. Среди наиболее часто встречающихся возбудителей нозокомиальных хирургических инфекций в многопрофильных стационарах микроорганизмы из группы «ESCAPE» (E. faecium, S. aureus, K. pneumoniae, A. baumannii, P. aeruginosa и Enterobacter spp.) составляют 73,56% от общего числа патогенов. При рассмотрении этиологической структуры нозокомиальной хирургической инфекции в зависимости от географической локализации стационара стоит отметить, что, несмотря на незначительные флуктуации, структура патогенов остается мало изменчивой на протяжении времени и схожа между отдельными федеральными округами. Однако, выявлена вариабельность данных по частоте выделения для S. aureus, при этом максимальные частоты наблюдаются в Центральном и Приволжском федеральных округах. В свою очередь S. aureus занимает первое место по частоте выделения, несмотря на географическую локализацию стационара. Заключение. На основе результатов исследования сделано заключение о преобладании в этиологической структуре нозокомиальных хирургических инфекций S. aureus (34,98%), P. aeruginosa (19,63%), E. coli (9,80%), A. baumannii (9,29%) и K. pneumoniae (7,48%).
Похожие темы научных работ по клинической медицине , автор научной работы — Кузьменков Алексей Юрьевич
Особенности таксономической структуры и резистентности к антибиотикам микрофлоры, изолированной от больных в многопрофильном хирургическом стационаре Чувствительность нозокомиальных штаммов K. pneumoniae, p. aeruginosa, A. baumannii и p. mirabilis к антисептику на основе хлоргексидина Видовой состав и антибиотикорезистентность возбудителей гнойно-септических инфекций в многопрофильной больнице Проблема полирезистентности основных возбудителей нозокомиальной инфекции у хирургических пациентов в многопрофильном онкологическом стационаре Микробиологический мониторинг за возбудителями нозокомиальных инфекций в отделениях реанимации и интенсивной терапии i Не можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.ETIOLOGICAL STRUCTURE OF HOSPITAL-ACQUIRED SURGICAL INFECTIONS IN MULTI-PROFILE HOSPITALS IN RUSSIAN FEDERATION
Фаги эффективны против бактерий ESCAPE
В систематическом обзоре установлено, что фаготерапия эффективна и безопасна для лечения инфекций, вызванных бактериями ESCAPE - патогенами, которые чаще всего демонстрируют устойчивость к антибиотикам и являются причиной большинства госпитальных инфекций
ESCAPE - это не только аббревиатура названий бактерий Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, представителей семейства Enterobacteriaceae, но и игра слов: escape с англ. - ускользать. А патогены ESCAPE известны тем, что часто «ускользают» от воздействия целого ряда антибиотиков.
Распространение мультирезистентных штаммов бактерий требует срочного поиска средств борьбы с ними. Перспективным направлением лечения мультирезистентных инфекций является использование бактериофагов, специфичных к возбудителям, - фаготерапия.
В журнале Clinical Infectious Diseases группа ученых из Университета Техаса (США) опубликовала систематический обзор*, в котором подведены итоги и дана критическая оценка работам по использованию бактериофагов в клинической практике. Также в обзоре представлены критерии и рекомендации для клиницистов и ученых по эффективной фаготерапии. Для анализа из 1102 статей, найденных в базах PubMed, Ovid, EMBASE и библиотеке Cochrane, были выбраны 30, которые отвечали определенным характеристикам (целевые бактерии, когорты пациентов, дизайн исследования). В большинстве исследований использовались не монопрепараты, а фаговые коктейли.
Всего в этих 30 исследованиях приняли участие более 1105 пациентов в возрасте от 6 месяцев до 101 года, с инфекциями, вызванными патогенами ESKAPE. В 87% исследований фаготерапия была эффективной против целевых патогенов. В 67% было доказано, что использованные фагопрепараты безопасны. В двух исследованиях были зафиксированы побочные эффекты после фаготерапии, но не доказана их непосредственная связь с фаготерапией.
«В эру растущей резистентности к антимикробным средствам, клиническая фаготерапия выглядит эффективной и безопасной стратегией снижения давления мультирезистентных микроорганизмов, - отмечают авторы обзора. - Клинические исследования и регуляторные изменения необходимы для изучения эффективности и безопасности фагов и расширения их применения в лечении мультирезистентных инфекций».
Бактериофаги (фаги) – вирусы бактерий, природные антимикробные агенты, безопасные для людей и животных. Фаготерапия – использование бактериофагов для лечения бактериальных инфекций, в том числе, устойчивых к антибиотикам. Бактериофаги – безопасная альтернатива антибиотикам.
Текст научной работы на тему «Этиологическая структура возбудителей нозокомиальных хирургических инфекций в многопрофильных стационарах Российской Федерации»
ЭТИОЛОГИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА ВОЗБУДИТЕЛЕЙ НОЗОКОМИАЛЬНЫХ ХИРУРГИЧЕСКИХ ИНФЕКЦИЙ В МНОГОПРОФИЛЬНЫХ СТАЦИОНАРАХ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ © Кузьменков А.Ю.
Смоленский государственный медицинский университет, НИИ антимикробной химиотерапии, Россия, 214019, Смоленск, ул. Кирова, 46а
Цель. Проанализировать этиологическую структуру возбудителей нозокомиальных хирургических инфекций в многопрофильных стационарах Российской Федерации.
Методика. Представленная работа является ретроспективной и основана на данных, полученных в рамках проспективных многоцентровых эпидемиологических исследований антибиотико-резистентности за период с 1997 по 2015 гг. Всего в исследование было включено 5118 пациентов с установленным фактом наличия нозокомиальной хирургической инфекции из 37 городов Российской Федерации.
Результаты. Полученные данные отражают возрастно-половой состав изучаемой группы пациентов, этиологическую структуру и её изменение с течением времени в различных федеральных округах Российской Федерации. Так среди обследованных пациентов мужчины составили 61,77%, женщины - 38,23%. Возрастные характеристики в зависимости от пола распределились следующим образом: медиана возраста мужчин составила 48 (34; 59) лет, медиана возраста женщин - 53 (39; 67) лет. Среди наиболее часто встречающихся возбудителей нозокомиальных хирургических инфекций в многопрофильных стационарах микроорганизмы из группы «ESCAPE» (E. faecium, S. aureus, K. pneumoniae, A. baumannii, P. aeruginosa и Enterobacter spp.j составляют 73,56% от общего числа патогенов. При рассмотрении этиологической структуры нозокомиальной хирургической инфекции в зависимости от географической локализации стационара стоит отметить, что, несмотря на незначительные флуктуации, структура патогенов остается мало изменчивой на протяжении времени и схожа между отдельными федеральными округами. Однако, выявлена вариабельность данных по частоте выделения для S. aureus, при этом максимальные частоты наблюдаются в Центральном и Приволжском федеральных округах. В свою очередь S. aureus занимает первое место по частоте выделения, несмотря на географическую локализацию стационара.
Заключение. На основе результатов исследования сделано заключение о преобладании в этиологической структуре нозокомиальных хирургических инфекций S. aureus (34,98%), P. aeruginosa (19,63%), E. coli (9,80%), A. baumannii (9,29%) и K. pneumoniae (7,48%).
Ключевые слова: хирургические инфекции, нозокомиальные инфекции, этиологическая структура инфекций
Smolensk State Medical University, Institute of Antimicrobial Chemotherapy, 46a, Kirova St., 214019, Smolensk, Russia
Objective. To analyze the etiological structure of hospital-acquired surgical infections in multi-profile hospitals in the Russian Federation.
Methods. The article is based on the data collected in the prospective multicenter epidemiological studies of antibiotic resistance for the time period from 1997 to 2015 years. A total of 5118 patients with the established fact of the presence of hospital-acquired surgical infection were included in the current study from 37 cities of the Russian Federation.
spp.) was 73.56%. It should be noted that the etiological structure of hospital-acquired surgical infection, despite minor fluctuations, did not change significantly over time and it was similar between the federal districts. Nevertheless, there was variability of frequency of identification of S. aureus, with the maximum frequencies observed in the Central and Volga federal districts. However, S. aureus was the first in frequency of identification, despite the geographical location of the hospital.
Conclusion. Based on our results, we concluded that S. aureus (34.98%), P. aeruginosa (19.63%), E. coli (9.80%), A. baumannii (9.29%), K. pneumoniae (7.48%) are the most common pathogens in the etiological structure of hospital-acquired surgical infections.
Keywords: surgical infections, hospital-acquired infections, etiological structure of infections
В большинстве случаев источником инфекции является микрофлора кожи пациента, слизистых оболочек или полых органов [2]. Среди оперативных вмешательств, не сопровождающихся вскрытием просвета пищеварительного тракта и мочевых путей (оперативные вмешательства в кардиоторакальной хирургии, ортопедии, нейрохирургии, офтальмологии), типичными контаминирующими микроорганизмами, способными вызвать ИОХВ, являются аэробные грамположительные бактерии, среди которых доминирует S. aureus, в том числе метициллин-резистентные S. aureus (MRSA), доля которых в структуре инфекций в последние годы возрастает [3, 8]. В свою очередь, вскрытие просвета полого органа при урологических операциях, в хирургии желчных путей, хирургии гастродуоденальной зоны, в колоректальной хирургии сопровождается контаминацией окружающих тканей грамотрицательными бактериями, такими как E. coli, Klebsiella süü., Proteus süü., грамположительными микроорганизмами, такими как Enterococcus spp., анаэробами, таким как B. fragilis [7].
Знание частот выделения этиологически значимых микроорганизмов при нозокомиальных хирургических инфекциях позволяет проводить эффективную антибиотикопрофилактику и антибиотикотерапию.
Цель исследования — анализ этиологической структуры возбудителей нозокомиальных хирургических инфекций в многопрофильных стационарах Российской Федерации.
Представленная исследовательская работа является ретроспективной и основана на данных, полученных в рамках проспективных многоцентровых эпидемиологических исследований антибиотикорезистентности, проводимых НИИ антимикробной химиотерапии (НИИАХ) ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Минздрава России и Межрегиональной ассоциацией по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии (МАКМАХ) за период с 1997 по 2015 гг. Всего в исследование было включено 5118 пациентов с установленным фактом наличия нозокомиальной хирургической инфекции из 37 городов Российской Федерации. Сбор клинического материала у больных производился в 74 исследовательских центрах.
Все расчеты были проведены на свободно распространяемом языке программирования Я. Для категориальных переменных проводился расчет абсолютной (количество) и относительной частот (%), а также 95%-ого доверительного интервала (95% ДИ) для относительной частоты по методу Уилсона. Непрерывные переменные описывались как медиана с первым и третьим квартилем — Ме (Кв1; Кв2). Все статистические тесты являлись двусторонними. При проверке гипотез использован уровень значимости а = 0,05. Для сравнения качественных переменных применялся точный критерий Фишера с использованием процесса Монте-Карло. В случае сравнения более двух групп полученные значения вероятности ошибки первого рода были откорректированы с помощью поправки Холма.
В исследуемой группе у 5118 пациентов было выделено 6298 изолятов. Среди обследованных пациентов мужчины составили 61,77%, женщины - 38,23%. Возрастные характеристики в зависимости от пола распределились следующим образом: медиана возраста мужчин составила 48 (34; 59) лет, медиана возраста женщин составила 53 (39; 67) лет.
Из структуры полученного клинического материала суммарно по всем городам большинство изолятов было выделено при развитии раневой инфекции (табл. 1), а структура клинического материала, полученного в рамках данного исследования, схожа для всех городов.
Таблица 1. Структура полученного клинического материала
i Не можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.Раневое отделяемое 4960 78,76%
Отделяемое по дренажу 334 5,30%
Перитонеальная жидкость 281 4,46%
Биоптат 274 4,35%
Абсцесс 271 4,30%
Синовиальная жидкость 7 0,11%
Аутопсийный материал 5 0,08%
Наиболее часто выделяемым микроорганизмом среди всех исследуемых пациентов являлся S. aureus (34,98%), вторым по частоте - P. aeruginosa (19,63%), третьим - E. coli (9,80%). Четвертым и пятым по частоте выделения явились A. baumanii и K. pneumoniae (9,29% и 7,48% соответственно). Структура всех выделенных микроорганизмов представлена в таблице 2. Следует отметить, что представленный в настоящем исследовании объем выборки минимизирует ширину 95% ДИ, что в свою очередь в достаточной мере позволяет оценить этиологическую структуру и выделить преобладающие микроорганизмы.
Таблица 2. Наиболее частые возбудители нозокомиальных хирургических инфекций с 1997 по 2015 гг.
Микроорганизм Количество % 95% ДИ
S. aureus 2203 34,98 33,81-36,17
P. aeruginosa 1236 19,63 18,66-20,62
E. coli 617 9,80 9,09-10,56
A. baumannii 585 9,29 8,6-10,03
K. pneumoniae 471 7,48 6,85-8,15
E. faecalis 252 4,00 3,54-4,51
P. mirabilis 191 3,03 2,64-3,49
E. cloacae 185 2,94 2,55-3,38
E.faecium 132 2,10 1,77-2,48
Из табл. 2 видно, что за период с 1997 по 2015 гг. среди наиболее часто встречающихся возбудителей нозокомиальных хирургических инфекций в многопрофильных стационарах первые девять микроорганизмов в общей структуре составляют более 93%, а представители группы «ESCAPE» (E.faecium, S. aureus, K. pneumoniae, A. baumannii, P. aeruginosa и Enterobacter spp.) -73,56% от общего числа. Оценить динамику частот выделения микроорганизмов, доля которых составила менее 2% в общей структуре, невозможно, поэтому в дальнейшем анализе этиологической структуры по годам эти микроорганизмы были объединены в категорию «Другие микроорганизмы» и отдельно не рассматривались.
Ниже на рис. 1 представлена динамика частот выделения A. baumannii, E. cloacae, E. coli, E. faecalis, E.faecium, K. pneumoniae, P. aeruginosa, P. mirabilis, S. aureus за период с 1997 по 2015 гг. Точками обозначена доля, которую составил микроорганизм от общего числа за соответствующий год, а вертикальные линии соответствуют 95% ДИ. Тренды построенных ядерных регрессий на рисунке 1 обозначены кривой, а серая зона соответствует их 95% ДИ. При анализе трендов видно, что в целом частоты выделения изучаемых микроорганизмов не меняются с течением времени, а отличающиеся между собой точки находятся в пределах перекрытия их 95% ДИ. На трендах отчетливо видны локальные «всплески», обусловленные появлением
отличающихся частот у A. baumannii, P. aeruginosa, P. mirabilis, однако это связанно с относительно малым числом изолятов (от 1 до 6), о чем свидетельствует широкий 95% ДИ. Таким образом, динамика выделения изучаемых микроорганизмов существенно не меняется с течением времени, а доминирующим по частоте выделения микроорганизмом является S. aureus.
A, baumatmi Е, с Е-coli
i Не можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.Рис. 1. Частоты выделения микроорганизмов по годам
В представленном исследовании интерес представляло рассмотрение этиологической структуры нозокомиальной хирургической инфекции в многопрофильных стационарах в зависимости от географической локализации стационара (на уровне федеральных округов). Ниже, на рис. 2, представлен график этиологической структуры в зависимости от федеральных округов за период с 1997 по 2015 гг., точки соответствуют частоте выделения микроорганизма в процентах, горизонтальные черные линии - 95% ДИ, пунктирные вертикальные линии - медиане частот выделения по всем федеральным округам. Видно, что частоты выделения E. cloacae, E. coli, E. faecalis, E. faecium, P. aeruginosa, P. mirabilis существенно не различаются между федеральными округами (рассчитанные 95% ДИ пересекают медиану частот выделения). По частоте выделения A. baumannii существенно отличается Уральский федеральный округ - 17,68% (95% ДИ: 15,25-20,41%) при медианном уровне, рассчитанном по всем федеральным округам в 7,8%, однако для Уральского федерального округа данный микроорганизм занимает третье место по частоте выделения, что согласовывается с общей тенденцией. Частота выделения K. pneumoniae существенно выше в Северо-Западном федеральном округе (16,05%; 95% ДИ: 12,33-20,64%) по сравнению с медианным уровнем (7,53%), однако для Северо-Западного федерального округа данный микроорганизм занимает второе место по частоте выделения. Следует отметить, что частоты выделения P. aeruginosa, P. mirabilis, S. aureus для Северо-Кавказского федерального округа обладают широким 95% ДИ, что связно с малым объемом выборки (17 изолятов).
Частоты выделения S. aureus существенно разнятся между отдельными федеральными округами, что заслужило отдельного рассмотрения. При попарном сравнении частот выделения S. aureus между федеральными округами, были выявлены статистически значимые отличия между Центральным федеральным округом и всеми остальными округами (за исключением Приволжского и Северо-Кавказского федеральных округов), а также между Приволжским федеральным округом и всеми остальными округами (за исключением Центрального и СевероКавказского федеральных округов). Вероятность ошибки первого рода (p) при наличии статистически значимых различий во всех случаях составила <0,0001. Данный результат свидетельствует о статистически значимом превышении частот выделения S. aureus при нозокомиальных хирургических инфекциях в Центральном и Приволжском федеральных округах
(41,85% и 42,55% соответственно) по сравнению с остальными федеральными округами (медианный уровень 30,9%). Отсутствие статистически значимых различий по сравнению с Северо-Кавказским федеральным округом обусловлено недостаточной мощностью теста для изучаемого объема выборки в 17 изолятов.
Южный ФО Центральный ФО Уральский ФО Сибирский ФО Северо-Кавказский ФО С&звро-ЗэтдныО ФО Приволжский ФО Дальневосточный ФО
Южный ФО Центральный ФО Уральский ФО Сибирский ФО Северо-Кавказский ФО Северо-Западный ФО Приволжский ФО Дальневосточный ФО
Южный ФО ЦвнтрЫьный ФО Уральский ФО Сибирский ФО Северо-Кэвказскио ФО Сеевро-Запедный ФО Приволжский ФО Дальневосточный ФО
Рис. 2. Частота выделения микроорганизмов в различных федеральных округах в процентах
В целом, несмотря на незначительные флуктуации, структура микроорганизмов нозокомиальных хирургических инфекций многопрофильных стационаров остается мало изменчивой на протяжении времени и схожа между отдельными федеральными округами. Наибольшая вариабельность данных по частоте выделения наблюдается для S. aureus, при этом максимальные частоты наблюдаются в Центральном и Приволжском федеральных округах (выявлены статистически значимые различия по сравнению с другими округами). Однако, для всех федеральных округов S. aureus занимает первое место по частоте выделения. Второе, третье, четвертое и пятое место во всех федеральных округах по частоте выделения делят P. aeruginosa, E. coli, A. baumannii, K. pneumoniae.
В рамках проведенного нами исследования при изучении этиологической структуры нозокомиальных хирургических инфекций наиболее частым возбудителем являлся S. aureus, частота выделения которого составила 34,98% (95% ДИ: 33,81-36,17%), что согласуется с результатами других авторов [4, 6]. Стоит отметить, что частота выделения S. aureus варьирует между федеральными округами и колеблется от 22,77% в Южном федеральном округе до более 40% в Центральном, Приволжском и Северо-Кавказском федеральных округах (выявлены статистически значимые различия). Данный факт может быть объяснен влиянием различия в структуре полученного клинического материала от исследовательских центров, а также типами оперативных вмешательств. Логично предположить, что чем больше в структуре клинического материала преобладает раневое отделяемое и чем менее глубокая ИОХВ, тем более вероятно преобладание в этиологической структуре контаминирующих кожные покровы микроорганизмов,
Читайте также: